تعیین توالی نوکلئوتیدی ژن aroa جدا شده از طیور مبتلا به کلی باسیلوز در ایران و مقایسه آن با سویه های موجود در بانک ژنی

ژن aroa یکی از ژن های مهم برای تولید اسید آمینه های آروماتیک می باشد و برای حیات باکتری بسیار ضروری است. نشان داده شده است، که توالی ژنی aroa در باکتری ها متفاوت است، بنابر این هدف این مطالعه تعیین توالی نوکلئوتیدی ژن aroa در سویه اشریشیا کلی بومی 80: k78o برای مشخص کردن تفاوت ها بین این سویه و سویه های موجود در بانک ژنی اشریشیا کلی 80: k78o بود. برای ازدیاد ژن aroa در سویه بومی از واکنش زنجیره ای پلی مراز استفاده شد. محصول 1206 بازی واکنش زنجیره ای پلی مراز از ژل الکترو فورز استخراج و در پلاسمید r57ptz همسان سازی شد و سپس توالی نوکلئوتیدی آن تعیین گردید. این توالی هم از نظر توالی نوکلئوتیدی و هم از نظر توالی اسید آمینه ای با سویه های موجود در بانک ژنی مقایسه شد. نتایج نشان داد که توالی در ژن aroa اشریشیا کلی بومی با سویه های اشریشیا کلی موجود در بانک ژنی از لحاظ 2 اسید آمینه تفاوت دارد، که به ترتیب عبارتند از از اسیدآمینه سی و نهم سویه های موجود در بانک ژنی که ترئونین (threonine) است و به جای آن در سویه بومی ایزولوسین ((isoleucine قرار گرفته و دیگری اسیدآمینه دویست و چهلم که به جای اسید گلوتامیک ((glutamic acidدر سویه های موجود در بانک ژنی، گلیسین ((glycine در سویه بومی نشسته است. دانستن این تفاوت ها برای انجام روش های مولکولی، طراحی آغازگرهای مختلف و تحقیقات بعدی مهم است.